Najdlhšou jaskyňou Jánskej doliny je Jaskyňa zlomísk. Jej vchod sa nachádza v nadmorskej výške 854 metrov. Dosahuje dĺžku takmer 11 kilometrov pri denivelácii 147 metrov.
obr. 1: jaskyňa Zlomísk
obr. 2: jaskyňa Zlomísk
obr. 3: Stanišovské jaskyňe
obr. 4: Stanišovské jaskyňe
Ďalšie významné jaskyne sú Stanišovská s dĺžkou 3138 metrov a vchodom v nadmorskej výške 761 metrov, Nová Stanišovská s dĺžkou 2334 metrov, ktorá vývojovo súvisí so Stanišovskou jaskyňou, a Sokolová jaskyňa. Táto sa nachádza už v masíve Ohnišťa (1538 m n. m.), ale vody, ktoré ňou pretekajú vychádzajú na povrch vo výverovej jaskyni Hlbokô, ktorá dosahuje dĺžku 308 metrov a jej vchod sa nachádza v nadmorskej výške 774 metrov.
Významnou výverovou jaskyňou, ktorej vchod sa nachádza v nadmorskej výške 777 metrov je takmer 500 metrov dlhá jaskyňa s názvom Občasná vyvieračka v Medzibrodí.
Pre stanisovska.sk napísal Ing. Peter Holúbek